« L’Institut » nous plonge dans les mystères d’une organisation secrète qui enlève des enfants dotés de pouvoirs psychiques et les utilise pour des missions ultrasecrètes dans le but de « sauver le monde ». Luke Ellis, un surdoué qui a le pouvoir de télékinésie, est le dernier kidnappé. Il est déterminé à s’échapper avec ses nouveaux amis et espère trouver un moyen de faire tomber l’organisation.